Основой музейной коллекции является обширное собрание предметов быта, оружия и произведений искусства коренных народов Севера. Здесь хранятся также палеонтологические находки, редкие фотографии и ботаническая коллекция. Жемчужина музейной коллекции – мамонтенок Люба. Теперь это не только бренд музея, но и всего региона, и Люба стала объектом интереса научного и музейного сообществ, любимцем детской аудитории, героем издательских проектов. Люба побывала в крупных городах России, а также в США, Китае, Японии, Великобритании, Канаде и в Австралии.
Помимо постоянной этнокультурной и краеведческой экспозиции, в музее проходят временные выставки. Комплекс Шемановского является популярной площадкой для детских и подростковых образовательных проектов, форумов и региональных праздников. Художественное собрание представлено традиционными для региона произведениями ямальского косторезного искусства и современными работами российских и зарубежных мастеров, посвященных Ямалу.